โรงพยาบาลแม่สาย มุ่งเน้นการพัฒนาระบบ ให้เป็นศูนย์บริการสุขภาพทุติยภูมิระดับสูง
และเป็นศูนย์กลาง การฝึกอบรมบุคลากรของกลุ่มประเทศลุ่มแม่น้ำโขง ด้วยการใช้นวตกรรม
ในการเพิ่มขีดความสามารถในการบริหารจัดการและบริการ ที่มีประสิทธิภาพ
พร้อมกับขยายความร่วมมือ บริการสุขภาพกับเครือข่ายพันธมิตรทุกภาคส่วน